Estas son algunas de las alternativas de CPanel
Panel tanto para Linux como también para Windows configurando el entorno web.
Más información https://www.plesk.com/pricing/
Es muy amigable con Nginx y más con PHP FPM.
Más información https://vestacp.com/
Herramienta de configuración de sistemas accesible vía web para sistemas Unix.
Más información https://www.webmin.com/
Con una amplia interfaz gráfica administrando tu servidor Linux
Con DirectAdmin puede administrar gracias a sus herramientas y funciones, todos sus dominios independientemente en la misma cuenta de hosting. Cada página web tendrá sus propias cuentas de correo, bases de datos MySQL, copias de seguridad, cuentas de FTP, redirecciones y archivos separados de las demás páginas.
DirectAdmin no le pondrá límites a la hora de alojar todos sus dominios en nuestros planes de Hosting Multidominio.